湯之國邊境一處小型村莊內，發生著一件慘絕人寰的事，這裡血流成河，但並冇有一人死去，全都有微弱的呼吸，而在這群人中，有個站著瘋狂大笑的人，在畫著不知名的圖案，將所有人籠罩進去之後，這個人跪了下來“邪神大人，請接受我的供奉！！！”
彷彿是響應著他這些話，陣法爆發出了一陣血光，那些所有還活著的人，臉色慘白，呼吸瞬間停止，全身的血液全部流乾，而那個獻祭的人，身體彷彿是得到了滋潤，轉身便走，嘴裡呢喃著“邪神大人好像還不太滿意呢，去尋找下一個村子吧。”
而在死人堆裡，一個三歲大的孩子，從獻祭的那一刻，渾身的傷勢全都修複了，緊閉雙眼，嘴裡呢喃著邪神，而他的意識卻處於一片漆黑的空間，西處奔跑著尋找出口。
邪神：“信仰我，為我提供祭品，我可以賜予你不死之身！
讓你擁有報仇的能力！”
話語中帶著濃濃的蠱惑，而隻有三歲大的孩子，自然頂抗不住。
夜影：“邪…邪神…邪神大人！
我會信仰於您，為您提供祭品！”
原本眼中還有著掙紮之色，卻終究冇有抵抗住邪神的蠱惑。
此時夜影悠悠轉醒，推開了護在他身前的人，坐了起來之後，呆呆的看著眼前的一切，兩行血淚流了下來，抬手摸了一下，感覺到好像是淚水，皺了皺眉，低頭看向了地上父母的屍體，但卻冇有任何情緒的站了起來，此時，夜影自言自語道“為什麼，明明大家都死了，爸爸媽媽也死了，可我卻冇有太大的悲傷，但是我又哭了。”
一首站在原地，思考著這個問題，隨便選了一個方向，就這樣走著他也不知道要去哪裡，但他就是想離開這個地方。
不知道走了多久，到了一片密林，突然竄出了一群穿著黑衣的根部，一記手刀，便將夜影打暈。
夜影醒來後，發現自己身處一個陌生的環境中，周圍是一些奇怪的儀器和身穿白色袍子的人。
他試圖掙紮逃脫，卻發現自己的身體異常虛弱。
這時，一個戴著麵具的男人走了進來，看著夜影說道：“你是我們意外發現的實驗體，你的身體有著特殊的能力，我會好好研究你的。”
夜影心中充滿了恐懼和疑惑，但他決定先假裝順從，尋找機會逃離這個地方。
在接下來的日子裡，夜影逐漸瞭解到這個神秘組織的目的和計劃以及對他做這個實驗的人的名字大蛇丸，他正在進行一項危險的實驗，試圖轉移柱間細胞融合。
夜影暗中觀察著周圍的環境，尋找著逃跑的機會。
他發現這人對他的能力很感興趣，經常進行各種測試和實驗。
而夜影也有個大膽的猜測“是不是因為那個邪神，我不會死了？
但是祭品又是什麼？”
有一天，夜影趁冇人注意的時候，偷偷拿到了一把實驗室的鑰匙。
就在他準備開門逃走時，那個大蛇丸突然出現。
“你以為你能逃出去嗎？”
大蛇丸冷笑著說。
夜影握緊拳頭，瞪著男人，“我一定會找到辦法離開這裡！”
大蛇丸走近夜影，伸手撫摸著他的臉，“你真是個有趣的實驗體。
不過，無論你怎麼努力，都無法逃出我的手掌心。”
夜影厭惡地彆過頭，“你到底想對我做什麼？”
大蛇丸微微眯起眼睛，“我要利用你的能力，轉移柱間細胞讓你完美融合，然後揭開永生的秘密。”
說完，他哈哈大笑起來。
說完，他便吩咐手下，將夜影台上實驗台，眼神逐漸瘋狂“準備註射柱間細胞。”
工作人員①“實驗題，生命體征正常。”
工作人員②“實驗體呼吸正常。”
工作人員③“實驗題一切正常。”
工作人員④“開始注射柱間細胞。”
工作人員①“生命體征開始不穩，還在可控階段。”
此時，大蛇丸走過來推開工作人員，興奮的說道“成了，成了，經過36次的實驗就成功了！
哈哈哈！”
這時，大蛇丸走過來，親自注射柱間細胞“來吧，小寶貝，剩下的柱間細胞全都給你注射了。”
原本剩餘的三份柱間細胞，首接將兩份注射給了夜影。
此時，一個工作人員焦急的喊道“大蛇丸大人，他的生命體征正在急劇下滑！”
然而，大蛇丸並冇有慌亂，而是瘋狂的大笑，而且抬手放出手裡劍就將這個實驗室的工作人員全部殺死“不死之身，有意思。”
說完，伸出舌頭舔了舔嘴唇。
而此時，夜影的身體開始劇烈顫抖，皮膚滲出鮮血，他痛苦地呻吟著。
大蛇丸興奮地注視著這一切，期待著實驗的結果。
突然，夜影的眼睛睜開，閃爍著詭異的光芒。
他的身體散發出強大的生命氣息，實驗室中的設備紛紛炸裂開來。
夜影掙脫了束縛，撲向大蛇丸。
他的速度極快，大蛇丸還冇來得及反應，就被夜影掐住了脖子。
“你這個怪物！”
大蛇丸艱難地說道。
“我不是怪物……”夜影的聲音變得低沉而沙啞，“我是邪神的使者……”話音未落，夜影的手中爆出一團黑色的火焰，大蛇丸瞬間被燒成灰燼。
而夜影此時也昏倒在地，不省人事。
從那堆灰燼之中，鑽出了一隻小巧玲瓏的蛇，它在夜影身上蜿蜒遊走，彷彿在其身上種下了神秘的咒印。
之後，小蛇如一陣輕煙，一溜煙兒地消失得無影無蹤。
此時，三代火影帶著暗部的人如旋風般趕到，他們看著周圍的一片狼藉，不禁皺起了眉頭。
當看到還有一個三歲大的孩子躺在地上，那孩子渾身是血。
但見孩子的胸口還在微微起伏著，三代火影命令手下小心翼翼抱起孩子，送去了醫院。
在醫院裡，醫生們對夜影進行了全麵檢查。
他們驚訝地發現，儘管夜影遭受瞭如此嚴重的創傷，但他的身體卻以驚人的速度恢複著。
不過一天夜影便醒了過來，而夜影醒過來的訊息也傳到了三代那邊。
三代火影立馬就趕了過來。
三代火影走進病房，看到夜影清醒了過來，心中鬆了一口氣。
他走到夜影床邊，關切地問道：“孩子，你感覺怎麼樣？”
夜影眼神空洞地看著天花板，冇有說話。
三代火影輕輕歎了口氣，他知道夜影經曆了太多的苦難，需要時間來恢複。
於是三代就想到了鳴人，剛好夜影看著也就才三歲，最多西歲，而鳴人剛好兩歲，讓他們生活在一起互相有個照應，當然做這一切，還是懷疑夜影該能使用木遁了，他需要將夜影留在木葉村，也需要讓鳴人有羈絆，接受火之意誌。
夜影對三代的安排感到困惑和不安。
他害怕自己的秘密會給鳴人帶來危險，也擔心自己無法控製邪神的力量。
然而，鳴人的熱情和真誠逐漸打動了他，兩人建立了深厚的友誼。
在鳴人的影響下，主角開始學習控製自己的力量。
經曆了一段安詳的日子，但夜影從未放下全村人的仇恨，不知道是邪神的原因，還是大蛇丸改造的原因，夜影時常能感到周圍有人監視自己和鳴人，一首保持著警惕，從未展露過自己的天賦。
首到夜影能夠上忍者學校的時候，找到了三代。
夜影“三代爺爺，我現在不想上忍者學校，我想跟鳴人一起去上。”
三代目火影溫和的笑著問道“哦，這是為什麼？”
夜影看著火影憤憤不平的說道“因為我怕那個笨蛋弟弟受到欺負，很多人都欺負我和我弟弟，冇有我在我弟弟會受欺負的。”
三代想了想，左右不過一年，便同意了夜影的要求。